Garnfiske er en effektiv og selektiv fiskemetode, men den har flere utfordringer knyttet til lokalisering av redskap, tap og miljøpåvirkning. Garn kan være vanskelig å lokalisere, spesielt i sterke strømmer og krevende havbunnsforhold, noe som kan føre til tap av både fangst og utstyr. Mistede garn og garnlenker kan bidra til såkalt spøkelsesfiske, og begrenset oversikt over redskapets posisjon, dybde og bevegelse kan gjøre fisket mindre effektivt og øke den operative risikoen.
