Sedimentfeller som plasseres på havbunnen opererer ofte ubemannede over lengre perioder i krevende miljøer, noe som medfører flere operative utfordringer. Sterke strømmer, bølger og varierende bunnforhold kan føre til forskyvning, helling eller feil orientering av fellen, noe som kan redusere kvaliteten på måledataene. Strømpåvirkning og lokal turbulens kan også virvle opp sedimenter på nytt, slik at prøvene ikke blir representative for den naturlige sedimentasjonen. Over tid kan biologisk begroing påvirke innsamlingsmekanismen og redusere funksjonaliteten.
I tillegg utsettes sedimentfeller for risiko knyttet til fiskeredskap, ankring og annen menneskelig aktivitet, noe som kan føre til skade eller tap av både utstyr og data. Manglende sanntidsinnsikt gjør at slike problemer ofte først oppdages ved opptak, samtidig som lokalisering, service og gjenfinning av utstyret kan være både tidkrevende og kostbart.
